Alors là, le coup du fils entouré dans les dents de la tige fileté, c'est plutôt une nouveauté dans le monde de la CN ici!
Comme le précise syvain et Mr Dus, je pense que ton chariot Y devrait avoir une autre règle de maçon placé à 90° de façon à ne pas partir "en canard".
Déjà là, après cette modif, les forces de transmission vont quasiment intégralement être transmises sur les PAP. C'est alors qu'ils joueront leur rôle.
La meilleure façon de tester les pertes de précision, c'est de prendre dans ta main (ou entre tes doigts) ta fraise (DREMEL à l'arrêt naturellement) et de forcer un déplacement, si tu vois la fraise bouger, c'est qu'il y a un pb... mais tu pourras également voir d'où il vient en fonction de ce qui bougera...
Après, tu peux toujours envisager de changer ta transmission, une tige fileté de 14 avec un écrou libre, l'ensemble bien graissé, ce système sera TRES lent quoi que sans doute aussi lent qu'actuellement, mais tu n'auras pas une perte de plus de 0.5 mm (si l'ensemble est bien posé) J'avais fait ma première comme ça, et sincèrement c'était acceptable, (si on oublie lenteur, grosse précision... et machine de petite taille < 1mètre par axe)
Il y a aussi (toujours à moindre coût) la chaîne de vélo + pignon dérailleur arrière + deux tendeurs de part et d'autre (vis avec crochet): Tu en aura pour 40€ max...
Voilà, si cela peut te donner des idées.