On est quand même sur du tout ou rien à fréquence quasi nulle sur une entrée TTL (ou assimilée ?) donc les longueur de fils sont sans importance, jusqu'à des km. Si on dépassait les 200m, on commencerait à regarder la section du fil mais ici, pas d'incidence.
Si ils s'avérait que la longueur joue, c'est au niveau de la source des parasites et sur leur cheminement qu'il faudrait s'interroger, pas la longueur des fils.
Quand vous serez de retour, des photos de la machine, du câblage, de l'organisation des cartes seraient une aide pour résoudre le souci. Il y a peut-être des choses que vous ne voyez pas et qui sauteront aux yeux de membres plus expérimentés.