Personnellement j'utilise Putty. Mais ton problème n'est pas le terminal, c'est le formatage des données.
Ce que tu devrais faire c'est modifier le code pour ne pas ajouter les caractères de fin de ligne.
Si changer le code n'est pas une option, alors tu peux faire ton propre terminal en python. Tu laisses python se connecter au port COM, tu lies toutes les données et tu les affiches toi même dans la console sans les caractères à ignorer.
En faisant ça, tu peux même ajouter des graphiques par la suite si ca te chante